Entlang der Thaya, die die Staatsgrenze zwischen Österreich und Tschechien bildet, greifen zwei Schutzgebiete ineinander: auf österreichischer Seite ist das der Nationalpark Thayatal, der sich im Übergangsbereich von Wald- und Weinviertel über 1.360 Hektar erstreckt. Auf tschechischer Seite geht das Schutzgebiet nahtlos in den 6.300 Hektar großen Nationalpark Podyjí über. Er liegt zwischen Znojmo (Znaim) und Vranov nad Dyjí (Frain an der Thaya) in Südmähren.
Die politische Grenze steht hier eindeutig im Hintergrund. Was zählt, ist die Natur, die ein einmaliges Tal geschaffen hat, das gemeinschaftlich geschützt wird.